Trung tâm có chức năng giúp Giám đốc Sở Y tế thực hiện nhiệm vụ cung cấp dịch vụ chuyên môn, kỹ thuật về y tế dự phòng, an toàn thực phẩm và các dịch vụ sự nghiệp y tế khác theo quy định của pháp luật.
Trung tâm chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp của Giám đốc Sở Y tế về tổ chức và hoạt động; đồng thời chịu sự chỉ đạo, kiểm tra, hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của Sở Y tế tỉnh Bắc Giang.
Nhiệm vụ của Trung tâm là triển khai, thực hiện các hoạt động cung cấp dịch vụ chuyên môn, kỹ thuật về y tế dự phòng gồm: Các hoạt động phòng, chống dịch bệnh như giám sát, sàng lọc phát hiện sớm, tiêm chủng, triển khai các biện pháp chống dịch và khắc phục hậu quả của dịch bệnh; phòng, chống yếu tố nguy cơ phát sinh, lây lan dịch, bệnh. Các hoạt động đảm bảo an toàn vệ sinh lao động; sức khỏe lao động, phòng, chống bệnh nghề nghiệp, tai nạn thương tích; vệ sinh môi trường, bảo vệ môi trường; phòng, chống các yếu tố nguy cơ có hại cho sức khỏe theo quy định của pháp luật, hướng dẫn lập hồ sơ quản lý sức khỏe người lao động.
Bên cạnh đó, Trung tâm có nhiệm vụ triển khai, thực hiện các hoạt động cung cấp dịch vụ chuyên môn, kỹ thuật về an toàn thực phẩm theo quy định của pháp luật và theo phân cấp. Thực hiện các hoạt động dịch vụ y tế trong phòng, chống khắc phục hậu quả thiên tai, thảm họa và đáp ứng trình trạng khẩn cấp về y tế. Hướng dẫn, kiểm tra, giám sát hỗ trợ về chuyên môn kỹ thuật đối với các bộ phận y tế thuộc doanh nghiệp.
Thực hiện việc tiếp nhận, cung ứng, bảo quản, cấp phát, sử dụng thuốc, vaccine, sinh phẩm y tế, hóa chất, trang thiết bị phục vụ cho hoạt động chuyên môn theo quy định của cấp có thẩm quyền và quy định của pháp luật. Nghiên cứu và tham gia nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ; ứng dụng phát triển khoa học kỹ thuật trong hoạt động chuyên môn.
Ngoài ra, Trung tâm thực hiện chế độ thống kê, báo cáo, xây dựng, tổng hợp, cung cấp thông tin cơ sở dữ liệu về y tế theo quy định. Quản lý nhân lực, tài chính, tài sản theo phân cấp và theo quy định của pháp luật.